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TATA结合蛋白

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TATA结合蛋白

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TATA结合蛋白

已知的結構

PDB

直系同源搜索: PDBe RCSB

PDBID列表
1TGH、1C9B、1JFI、1NVP、4ROC、4ROE、4ROD、5IY9、5IYA、5FUR、5IYC、5IYB、5IY7、5IY8、5IYD、5IY6

識別號

别名

TBP；, GTF2D, GTF2D1, HDL4, SCA17, TFIID, TATA-box binding protein, TATA-binding protein, TBP1

外部ID

OMIM：600075 MGI：101838 HomoloGene：2404 GeneCards：TBP

相關疾病

spinocerebellar ataxia type 17

基因位置（人类）

染色体	6號染色體

基因座	6q27	起始	170,554,302 bp
基因座	6q27	终止	170,572,870 bp

基因位置（小鼠）

染色体	小鼠17号染色体

基因座	17 A2\|17 8.95 cM	起始	15,720,150 bp
基因座	17 A2\|17 8.95 cM	终止	15,748,641 bp

RNA表达模式

查阅更多表达数据

基因本體
分子功能	• DNA结合 • DNA结合转录因子活性 • 转录因子结合 • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • 血浆蛋白结合 • 酶结合 • TFIIB-class transcription factor binding • aryl hydrocarbon receptor binding • 核心启动子近端区域序列特异性DNA结合 • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity • RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
細胞組分	• 細胞質 • transcription factor TFIID complex • male pronucleus • female pronucleus • 核质 • transcription factor TFIIA complex • pronucleus • 细胞核 • transcription preinitiation complex • 大分子复合体 • transcription factor TFIIIB complex • 轉錄調節複合物
生物學過程	• termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • regulation of transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription, DNA-templated • 精子发生 • DNA-templated transcription, initiation • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • viral process • regulation of transcription by RNA polymerase III • transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase III • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase III preinitiation complex assembly • transcription elongation from RNA polymerase I promoter
Sources:Amigo / QuickGO

直系同源

物種

人類

小鼠

Entrez


6908


21374

Ensembl


ENSG00000112592


ENSMUSG00000014767

UniProt


P20226


P29037

mRNA序列


NM_003194 NM_001172085


NM_013684

蛋白序列


NP_001165556 NP_003185


NP_038712

基因位置（UCSC）

Chr 6: 170.55 – 170.57 Mb

Chr 17: 15.72 – 15.75 Mb

PubMed查找

維基數據

檢視/編輯人類

檢視/編輯小鼠

TBP

crystal structure of a yeast brf1-tbp-dna ternary complex

鑑定

標誌

TBP

Pfam

PF00352（旧版）

Pfam宗系

CL0407（旧版）

1tbp / SUPFAM

現有可用的蛋白結構：
Pfam	結構（旧版） / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	結構概要

TATA结合蛋白质（英語：TATA-binding protein，TBP）是一种通用转录因子，具体结合于DNA序列上的TATA盒。TATA盒位于真核基因的转录起始位点上游约25个bp，属于啟動子区。TBP可以和各个TBP相关因子共同组成通用转录因子 TF_IID,再进一步组成RNA聚合酶Ⅱ的转录起始复合物。

蛋白质的相互作用

TATA结合蛋白与下列蛋白質进行互作：

BRF1,
BTAF1,
C-Fos,
C-jun,
EDF1,
GTF2B (TFIIB),
GTF2A1 (TFIIA subunit 1),
GTF2F1 (TFIIF subunit 1)
GTF2H4 (TFIIH subunit 4),
Mdm2,
MSX1,
NFYB,
P53,
PAX6,
POLR2A,
POU2F1,
RELA,
NR2B1,
TAF1,
TAF4,
TAF5,
TAF6,
TAF7,
TAF9.
TAF10,
TAF11,
TAF13,
TAF15.

外部链接

GeneReviews/NCBI/国家卫生研究院/大学进入脊髓小脑失调类型17（页面存档备份，存于互联网档案馆）
交互式TBP结构在梅西。ac.新西兰
每月PDB分子主題TATA-binding protein
醫學主題詞表（MeSH）：TATA-Box+Binding+Protein
FactorBook TBP

转录因子与细胞内受体

（1）碱性结构域

（1.1）碱性亮氨酸拉链（bZIP）	转录激活因子（AATF、1、2、3、4、5、6、7） · AP-1（c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND） · BACH（1、2） · BATF · BLZF1 · C/EBP（α、β、γ、δ、ε、ζ） · CREB（1、3、L1） · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF（B、F、G、K） · NFE（2、L1、L2、L3） · NFIL3 · NRL · NRF（1、2、3） · XBP1

（1.2）碱性螺旋-环-螺旋（bHLH）	ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL（ARNTL、ARNTL2） · CLOCK · EPAS1 · HAND（1、2） · HES（5、6） · HEY（1、2、L） · HES1 · HIF（1A、3A） · ID（1、2、3、4） · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins（1、2、3 · 肌形成调节因子（MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6） · NeuroD（1、2） · NPAS（1、2、3） · OLIG（1、2） · Pho4 · Scleraxis · TAL（1、2） · Twist · USF1

（1.3）bHLH-ZIP	AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP（1、2）

（1.4） NF-1	NFI（A、B、C、X） · SMAD（R-SMAD（1、2、3、5、9） - I-SMAD（6、7） - 4）

（1.5） RF-X	RFX（1、2、3、4、5、ANK）

（1.6）碱性螺旋-跨-螺旋（bHSH）	AP-2（α、β、γ、δ、ε）

（2）锌指结构DNA作用区域

（2.1）核受体（Cys₄）	第一亚族：甲状腺激素受体（α、β）、CAR、FXR、LXR（α、β）、PPAR（α、β/δ、γ）、PXR、RAR（α、β、γ）、ROR（α、β、γ）、 Rev-ErbA（α、β）、VDR 第二亚族（COUP-TF（I、II）、Ear-2、HNF4（α、γ）、PNR、RXR（α、β、γ）、Testicular receptor（2、4）、TLX）第三亚族（甾类激素（雄激素、雌激素（α、β）、糖皮质激素、盐皮质激素、孕酮）、雌激素相关（α、β、γ））第四亚族NUR（NGFIB、NOR1、NURR1） · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF · 第零亚族DAX1、SHP

（2.2）其他的Cys₄结构	GATA（1、2、3、4、5、6） · MTA（1、2、3） · TRPS1

（2.3） Cys₂His₂	通用转录因子（TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF（1、2）、TFⅡH（1、2、4、2I、3A、3C1、3C2）） ATBF1 · BCL（6、11A、11B） · CTCF · E4F1 · EGR（1、2、3、4） · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family（1、2、3、REST、S2、YY1） · HIC（1、2） · HIVEP（1、2、3） · IKZF（1、2、3） · ILF（2、3） · KLF（2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17） · MTF1 · MYT1 · OSR1 · SP（1、2、4、7） · WT1 · Zbtb7（7A、7B） · ZBTB（16、17、20、32、33、40） · zinc finger（3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655）

（2.4） Cys₆	HIVEP1

（2.5）交替composition	AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING（1、2、4） · JARID（1A、1B、1C、1D、2） · JMJD1B

（2.6）WRKY结构	WRKY转录因子家族

（3）螺旋-转角-螺旋结构域

（3.1）同源异型域	ARX · CDX（1、2） · CRX · CUTL1 · DBX（1、2） · DLX（3、4、5） · EMX2 · EN（1、2） · FHL（1、2、3） · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框（A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、 D12、D13） · HOPX · IRX（1、2、3、4、5、6、MKX） · LMX（1A、1B） · MEIS（1、2） · MEOX2 · MNX1 · MSX（1、2） · NANOG · NKX（2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2） · PBX（1、2、3） · PHF（1、3、6、8、10、16、17、20、21A） · PITX（1、2、3） · POU结构域（PIT-1、BRN-3: A、B、C、八聚体转录因子：1、2、3/4、6、7、11） · OTX（1、2） · PDX1 · ZEB（1、2）

（3.2）配对框	PAX（1、2、3、4、5、6、7、8、9）

（3.3）叉头状/翼状螺旋	E2F（1、2、3、4、5） · FOX proteins（C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2、P3）

（3.4）热休克因子	HSF（1、2、4）

（3.5）色氨酸簇	ELF（2、4、5） · EGF · ELK（1、3、4） · ERF · ERG · ETS（1、2、SPIB） · ETV（1、4、5、6） · FLI1 · Interferon regulatory factors（1、2、3、4、5、6、7、8） · MYB · MYBL2

（3.6）TEA结构域	transcriptional enhancer factor（1、2、3、4）

（4）具有小凹槽触点的β-支架因子

（4.1） Rel homology region	NF-κB（NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB） · NFAT（C1、C2、C3、C4、5）

（4.2） STAT	STAT（1、2、3、4、5、6）

（4.3） p53样转录因子	p53 p63 p73家族（p53 · p63 · p73） · TBX（1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1）

（4.4） MADS盒	Mef2（A、B、C、D） · SRF

（4.6） TATA结合蛋白	TATA结合蛋白 · TBPL1

（4.7）高迁移率族	BBX · HMGB（1、2、3、4） · HMGN、（1、2、3、4） · HNF（1A、1B） · SOX（1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21、SRY） · SSRP1 · TCF/LEF家族（TCF（1、3、4） · LEF1) · TOX（1、2、3、4）

（4.9） Grainyhead	TFCP2

（4.10）冷休克域	CSDA、YBX1

（4.11） Runt	CBF（CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1）

（0）其他转录因子

（0.2） HMGI（Y）	HMGA（1、2） · HBP1

（0.3）袋状结构域	Rb · RBL1 · RBL2

（0.5） AP-2/EREBP-related factors	Apetala 2 · EREBP · B3(ARF · ABI3 · RAV)

（0.6） Miscellaneous	ARID（1A、1B、2、3A、3B、4A） · CAP · IFI（16、35） · MLL（2、3、T1） · MNDA · NFY（A、B、C） · ρ因子/σ因子

参见转录因子/共调节因子缺陷
Category:蛋白质生物合成模板