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開放閱讀框

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样品序列显示三种不同的可能的阅读框。 起始密码子以紫色突出显示,而终止密码子以红色突出显示。

開放閱讀框(英語:Open reading frame;縮寫:ORF;其他譯名:開放閱讀框架開放讀架等)是指在給定的閱讀框架中,不包含终止密碼子的一串序列。這段序列是生物個體的基因組中,可能作為蛋白質編碼序列的部分。基因中的ORF包含並位於開始編碼與終止編碼之間。由於一段DNARNA序列有多種不同讀取方式,因此可能同時存在許多不同的開放閱讀框架。有一些電腦程式可分析出最有可能编码蛋白质的序列。

例子

一段5'-UCUAAAGGUCCA-3'序列。此序列共有3種讀取法:

  1. UCU AAA GGU CCA
  2. CUA AAG GUC
  3. UAA AGG UCC

由於UAA為終止密码子,因此第三種讀取法不具編譯出蛋白質的潛力,故只有前兩者為開放閱讀框架。

找ORF的软件

在线寻找ORF的软件:ORF Finder页面存档备份,存于互联网档案馆

功能

ORF Finder 被用来预测已存在的编码区的小基因序列。也可用于大规模的开放式阅读框寻找。

參見

外部連結


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