分子建模（英語：Molecular modelling）或稱分子模擬，是指利用理論方法與計算技術，模擬出化學分子的外觀或性質，屬於計算化學與計算生物學領域的研究對象。並且是化學與生物學上，如結構生物學等學門所應用的研究方法。
分子建模軟體
- Agile Molecule （页面存档备份，存于互联网档案馆）
- AMBER
- BALLView
- CHARMM
- Cerius2
- GAUSSIAN
- Ghemical
- GROMOS
- InsightII
- MarvinSpace
- MMTK
- MOE
- Molsoft ICM
- NOCH
- Oscail X
- PyMOL
- Sirius
- SPARTAN （页面存档备份，存于互联网档案馆）
- Sybyl（页面存档备份，存于互联网档案馆）
- VMD
- WHAT IF （页面存档备份，存于互联网档案馆）
參見
外部連結
- Center for Molecular Modeling at the National Institutes of Health (NIH) (U.S. Government Agency)
- Molecular Simulation
- The eCheminfo （页面存档备份，存于互联网档案馆） Network and Community of Practice in Informatics and Modeling
- Molecular Modelling Italian web portal
參考文獻
- A. R. Leach, Molecular Modelling: Principles and Applications, 2001, ISBN 0-582-38210-6
- D. Frenkel, B. Smit, Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to Applications, 1996, ISBN 0-12-267370-0
- D. C. Rapaport, The Art of Molecular Dynamics Simulation, 2004, ISBN 0-521-82586-7
- R. J. Sadus, Molecular Simulation of Fluids: Theory, Algorithms and Object-Orientation, 2002, ISBN 0-444-51082-6