Мы используем файлы cookie.
Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.
Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.
全基因组泛癌分析
Другие языки:
全基因组泛癌分析
Подписчиков: 0, рейтинг: 0
全基因组泛癌分析(英语:Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes,PCAWG)是由国际癌症基因组联盟(ICGC)组织的一个国际性合作项目,对超过2600组癌细胞基因进行分析。
历史
1984年,人类基因组计划被提出,旨在测定人类染色体的核苷酸序列。这一计划自1990年启动开始,于2003年完成。在这一计划中,有研究者希望借助同样的手段,通过对肿瘤基因组的表征,深入研究肿瘤。因此,癌症基因组图谱计划(TCGA)于2006年启动,对33个癌症类型和2万个癌症以及正常组织的分子特征进行测序分析。2008年,ICGC成立,负责系统性分析癌症基因突变。由于TCGA和ICGC的研究范围重叠,为实现泛癌分析的标准化,提高研究效率,由来自超过700个研究机构的研究者共同形成了PCAWG联盟,根据癌症基因的不同分析方向分为16个小组共同研究。
概述
PCAWG项目采纳了来自2793名捐献者的基因数据,数据总量接近800TB。2020年2月,ICGC发表这一项目的研究成果,是目前最全面的癌症基因组分析。
研究成果
2020年2月5日,PCAWG项目在Nature期刊上首先发表了6篇主要的研究成果。Nature的多个子刊中也刊登了多个项目阶段性成果。这6篇文章分别触及癌症基因组携带的驱动突变、非编码区域的改变、体细胞突变的特征、结构变异、肿瘤基因进化历程和RNA突变。
驱动突变
在对PCAWG数据库中的38种肿瘤类型所包含的2658个肿瘤全基因组进行整体分析后发现,当统计编码和非编码序列时,每一个肿瘤基因组平均携带4-5个驱动突变。
已发表研究
标题 | 发表刊物 | 发表时间 | 备注 |
---|---|---|---|
Pan-cancer analysis of whole genomes | Nature | 2020-02-05 | |
Patterns of somatic structural variation in human cancer genomes | Nature | 2020-02-05 | |
The repertoire of mutational signatures in human cancer | Nature | 2020-02-05 | |
The evolutionary history of 2,658 cancers | Nature | 2020-02-05 | |
Genomic basis for RNA alterations in cancer | Nature | 2020-02-05 | |
Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes | Nature | 2020-02-05 |