丹麥醫藥署(丹麥語:Lægemiddelstyrelsen)是丹麥衛生部的下屬機構。
丹麥醫藥署主管丹麥醫療用品、設備、藥物、興奮劑法規,以確保丹麥的醫藥品質水準,保障每個國民的用藥安全。功能上與美國食品藥品監督管理局類似。該機構也是丹麥研發系統「Biopeople」的一員,該系統總部位於哥本哈根大學。