| 生物分类学 |
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| 分类阶元 |
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域 | 界 | 门 | 纲 目 | 科 | 属 | 种 |
| 二名法 |
| 三域系統 |
| 介於生物和非生物（無生物）之間的物體——不屬於任何一分類界 |
| 細胞生物 |
三域系統 (Three-domain system) 是由美国微生物学家和生物物理学家卡尔·乌斯 (Carl Richard Woese)等人在1977年提出的細胞生命形式的分類，是古菌域 (Domain Archaea)、細菌域 (Domain Bacteria) 和真核域 (Domain Eukarya)。
乌斯依據16S 核糖体RNA序列上的差別，將原核生物分成兩大類，起初稱為真細菌和古細菌，認為這兩類生物和真核生物一起從一個具有原始遺傳機製的祖先（最後共同祖先）分別演化而來，因此將三者各置為一個「域」，作為比「界」(Kingdom) 高一級的分類系統。古菌域下有古細菌界 (Kingdom Archaea)，細菌域下有細菌界 (Kingdom Bacteria)，真核生物域下有六個界：囊泡藻界 (Chromalveolata)、古蟲界（Excavata）、有孔蟲界（Rhizaria）、真菌界 (Fungi)、植物界（Plantae）和動物界 (Animalia)。加上其他未專屬域下有病毒，和亞病毒因子兩個界，總共有 10 界。
然而，rRNA樹有可能將演化太快的類群放錯位置（比如微孢子蟲）。有人認為生物的根源應該在真細菌之內，很多真細菌的類群在古細菌之前分支出來，很晚古細菌和真核生物才彼此分開。
三域特徵比較
| 特徵 | 細菌域 Bacteria |
古菌域 Archaea |
真核域 Eukarya |
|---|---|---|---|
| 形態和遺傳 | |||
| 原核細胞結構 | 是 | 是 | 否 |
| 核膜 | 無 | 無 | 有 |
| 共價閉合環狀DNA | 是 | 是 | 否 |
| 質粒 | 有 | 有 | 稀少 |
| 核糖體大小 | 70S | 70S | 80S |
| 多數基因中有内含子 | 否 | 否 | 是 |
| 操縱子 | 有 | 有 | 無 |
| mRNA加5'端帽和3'聚A尾 | 無（部份有聚A尾，但作用與真核不同） | 無 | 有 |
| 組織蛋白 | 無 | 有 | 有 |
| 細胞壁 | 含胞壁酸 | 不含胞壁酸 | 不含胞壁酸 |
| 膜脂質 | 酯鍵連接 | 醚鍵連接 | 酯鍵連接 |
| 起始tRNA | 甲酰蛋氨酸 | 蛋氨酸 | 蛋氨酸 |
| 核糖體對泛素敏感 | 否 | 是 | 是 |
| RNA聚合酶 | 1個 | ||