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Pfam
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内容 | |
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有機體 | 全部 |
相關信息 | |
研究中心 | WTSI |
访问入口 | |
数据格式 | Stockholm format |
网站 | Pfam |
下載地址 | Pfam ftpPfam ftp |
工具 | |
其他 | |
许可 | GNU宽通用公共许可证 |
可否列為書籤 | yes |
Pfam是一個蛋白質家族資料庫。此資料庫會利用隱馬爾可夫模型進行多重序列比對以及加上蛋白腳註。
特色
Pfam中所登錄的每一個蛋白質家族可以:
- 查詢多重序列比對
- 查看蛋白質主要結構
- 檢視物種演化樹
- 連結其他資料庫
- 查看已知的蛋白質結構
Pfam內的蛋白質家族描述由維基百科使用者管理。
Pfam的最新版本是「Pfam 34.0」(2021年3月,共計19,179個家族)
參見
- TrEMBL Database performing an automated protein sequence annotation
- InterPro Integration of protein domain and protein family databases
- PDBfam(页面存档备份,存于互联网档案馆) — thorough assignment of Pfam domains to sequences in the Protein Data Bank (PDB)