EF手(英語:EF hand)是一种在钙结合蛋白中发现的螺旋-环-螺旋结构域或结构基序。
EF手包括一个螺旋-环-螺旋拓扑结构,就像人类的手上拇指和食指,而Ca2+离子与其配体就位于环内。这一结构最早在小清蛋白中发现,小清蛋白含有三个EF手结构,与钙离子结合而造成的肌肉放松有关。
EF手包含两个α螺旋,由一个短的(通常包括12个氨基酸)环状区域连接,常用于结合钙离子。EF手也出现在钙调蛋白的所有结构域和肌肉蛋白质肌钙蛋白C中。
钙离子结合位点
分类
- 自从EF手结构模体在1973年被描绘以来,迄今为止该家族的蛋白质已扩展到至少66个亚家族。EF手结构基元可以分为Canonical EF-hands和Pseudo EF-hands 两大类:
亚族
例子
人类基因组中,包含有EF手的蛋白质有:
另见
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锚定结构域,另一种由α-螺旋组成的钙结合结构基序。
延伸阅读
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Branden C, Tooze J. Chapter 2: Motifs of protein structure. Introduction to Protein Structure. New York: Garland Pub. 1999: 24–25. ISBN 0-8153-2305-0.
-
Nakayama S, Kretsinger RH. Evolution of the EF-hand family of proteins. Annu Rev Biophys Biomol Struct. 1994, 23: 473–507. PMID 7919790. doi:10.1146/annurev.bb.23.060194.002353.
-
Zhou Y, Yang W, Kirberger M, Lee HW, Ayalasomayajula G, Yang JJ. Prediction of EF-hand calcium-binding proteins and analysis of bacterial EF-hand proteins. Proteins. November 2006, 65 (3): 643–55. PMID 16981205. doi:10.1002/prot.21139.
-
Zhou Y, Frey TK, Yang JJ. Viral calciomics: interplays between Ca2+ and virus. Cell Calcium. July 2009, 46 (1): 1–17. PMID 19535138. doi:10.1016/j.ceca.2009.05.005.
-
Nakayama S, Moncrief ND, Kretsinger RH. Evolution of EF-hand calcium-modulated proteins. II. Domains of several subfamilies have diverse evolutionary histories. J. Mol. Evol. May 1992, 34 (5): 416–48. PMID 1602495. doi:10.1007/BF00162998.
-
Hogue CW, MacManus JP, Banville D, Szabo AG. Comparison of terbium (III) luminescence enhancement in mutants of EF hand calcium binding proteins. J. Biol. Chem. July 1992, 267 (19): 13340–7. PMID 1618836.
-
Bairoch A, Cox JA. EF-hand motifs in inositol phospholipid-specific phospholipase C. FEBS Lett. September 1990, 269 (2): 454–6. PMID 2401372. doi:10.1016/0014-5793(90)81214-9.
-
Finn BE, Forsén S. The evolving model of calmodulin structure, function and activation. Structure. January 1995, 3 (1): 7–11. PMID 7743133. doi:10.1016/S0969-2126(01)00130-7.
-
Stathopulos PB, Zheng L, Li GY, Plevin MJ, Ikura M. Structural and mechanistic insights into STIM1-mediated initiation of store-operated calcium entry. Cell. October 2008, 135 (1): 110–22. PMID 18854159. doi:10.1016/j.cell.2008.08.006.
-
Nelson MR, Thulin E, Fagan PA, Forsén S, Chazin WJ. The EF-hand domain: a globally cooperative structural unit. Protein Sci. February 2002, 11 (2): 198–205. PMC 2373453
. PMID 11790829. doi:10.1110/ps.33302.
外部链接
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蛋白质二级结构
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| 蛋白质二级结构 |
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| 倾向于产生螺旋结构的氨基酸: |
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| 倾向于产生延展结构的氨基酸: |
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| 倾向于产生无序结构的氨基酸: |
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| 无产生任何结构倾向的氨基酸: |
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