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CRISPR/Cpf1
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CRISPR/Cpf1

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CRISPR/Cpf1 是一种DNA编辑的技术,其原理CRISPR/Cas 系统类似。CRISPR/Cpf1 也藉由細菌古菌噬菌体获得性免疫机制来进行基因编辑。由于 Cpf1 蛋白是一种比 Cas9 蛋白更小而且更简单的核酸内切酶,这样把CRISPR/Cpf1系统植入待修改基因的细胞就相对更容易,CRISPR/Cpf1可能是一种比CRISPR/Cas9更好的基因编辑工具。

作用机理

基于核酸内切酶的基因编辑系统是由一个分子“剪刀”(如Cpf1)和一个由DNA构成的引导序列组成的。由DNA构成的引导序列会引领分子“剪刀”与靶向序列的DNA结合,使得靶向序列被切除。

由于原核生物需要保护自己免受噬菌体的侵袭,现有一种猜想认为每种噬菌体都有对应的分子“剪刀”免疫系统,所以还有大量的这样的系统等待人们去发现。

Cas9需要2条RNA分子来做DNA的剪切,然而,Cpf1只需要1条。Cas9蛋白在切割DNA双链时,两条链上的切口在两链的相同位置上,所以留下的末端是平末端(非粘性末端)。Cpf1蛋白则不同,其在DNA两条链上的切割位点不在同一位置上,因此会产生粘性末端。由于粘性末端的缘故,在Cpf1酶切末端上插入新序列比Cas9的酶切末端上更容易。

Cpf1只需要1个RNA序列来导引,并且不需要tracrRNA(tracrRNA在别的CRISPR/Cas系统中起到了促进引导RNA形成的作用)。Cpf1蛋白还使用了富含T碱基的PAM序列。

发现过程

Cpf1是在细菌的基因组数据库中搜索出来的,而且Cpf1基因在很多物种的基因组中都出现了 最终用于基因编辑的Cpf1蛋白是从16种含有Cpf1的细菌中的2种(AcidaminococcusLachnospiraceae )中提取出来的。

从Acidaminococcus和Lachnospiraceae 中找到的Cas1蛋白能够有效地在人体细胞中发挥基因编辑的作用。

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