羧(suō)肽酶(EC編號:3.4.16-3.4.18)屬於一種蛋白酶,可水解(裂解)蛋白質或肽的羧基端(C端)末的肽鍵。 過程與氨肽酶相反,該氨基肽酶在蛋白質的N末端能夠切割肽鍵。 人、動物、細菌,以及植物包含有幾種類型的羧肽酶,且具有從分解代謝至蛋白質成熟等之多種功能。
產生羧肽酶的機制涉及酶底物配位水被羰基(C=O)基團底物所取代之現象。