纤毛虫门 化石时期：
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| 恩斯特·海克尔所著的《自然界的艺术形态》中纤毛纲动物图片 | |
科学分类 
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| 演化支： | 雙鞭毛生物 Bikonta |
| 演化支： | 多貌生物 Diaphoretickes |
| 界： | 色藻界 Chromista |
| 亚界： | HAR 生物亞界 Harosa |
| 总门： | 囊泡蟲總門 Alveolata |
| 门： |
纤毛虫门 Ciliophora Doflein, 1901 |
纤毛虫是纤毛虫门（學名：Ciliophora）生物的通称，是一类较复杂的原生动物，主要特点是以纤毛作为运动器，细胞核一般分化出大核（营养）、小核（生殖）、摄食胞器等，无性生殖为横二分裂，有性生殖为接合生殖，生活在淡水或海水中，也有寄生的。代表生物有草履虫，小瓜虫等。
纤毛虫在分类上比较复杂，尚无统一的定论。按传统的分类，原生动物作为动物界中的一个门，纤毛虫为其中的“纤毛纲”（Ciliata），有时也将其列为原生动物门的纤毛亚门，或将原生动物看作动物界的一个亚界，纤毛虫划为一个门——纤毛门。按照汤玛斯·卡弗利尔-史密斯提出的分类系统则属于囊泡藻界的“纤毛虫门”（Ciliophora）。
细胞结构
细胞核
与其他大部分真核生物不同,纤毛虫有两种大小不同的核，一种是二倍体的小核，负责基因重组；另一种是多倍体的大核，负责一般细胞调控。
细胞质
食物通过胞吞作用，经过胞口胞咽进入食物泡，通过溶酶体分解使其颗粒变小，能通过膜扩散入细胞质中，残留在食物泡中的物质在胞肛处以胞吐作用排出。 大多数纤毛虫也具有一个或多个突出的收缩泡，收集和排出水以维持细胞内渗透压，以及维持离子平衡。在某些属中（如草履虫），收缩泡有着明显的星状造型，每个星芒都是一个收集管。
繁殖
纤毛虫都可以进行无性繁殖和有性繁殖。无性繁殖二分裂方式进行，小核发生有丝分裂,大核伸长并分为两半，然后该细胞一分为二。两个新细胞各获得一个大核和一个小核。 与此相反，有性繁殖涉及两个不同交配型（类似性别，但也存在两个以上的交配型）个体之间的结合和遗传物质的交换，这往往发生在食物短缺的时候。
分类
“纤毛虫门”分为两个亚门：
Postciliodesmatophora亚门
內大核亞門
- 旋毛纲 Spirotrichea Butschli, 1889
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叶口纲 Litostomatea Small & Lynn, 1981
- Subclass Haptoria (e.g. Didinium)
- 毛口亚纲 Trichostomatia Butschli, 1889
- Subclass Rhynchostomatia
-
叶咽纲 Phyllopharyngea de Puytorac et al., 1974
- 叶咽亚纲 Phyllopharyngia (e.g. Chilodonella uncinata
- Subclass Rhynchodia
- Subclass Chonotrichia
- 吸管亚纲 Suctoria (e.g. Podophrya)
- 篮口纲 Nassophorea Butschli, 1889
- Class Colpodea Small & Lynn, 1981 (e.g. Colpoda)
- 前口纲 Prostomatea (e.g. Coleps)
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寡膜纲 Oligohymenophorea de Puytorac et al., 1974
- 咽膜亚纲 Peniculia Corliss，1956 （如草履虫 Paramecium）
- 膜口亚纲 Hymenostomatia Delage & Herouard，1896 （如四膜虫Tetrahymena）
- Subclass Scuticociliatia
- 缘毛亚纲 Peritrichia Stein, 1859
- Subclass Astromatia
- Subclass Apostomatia
- Class Plagiopylea Small & Lynn, 1985
未归类
Genus Cryptocaryon（但WoRMS認為屬於前口綱前管蟲目裸口蟲科，只有 Cryptocaryon irritans Brown, 1951一個物種。）
参考资料
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