卫生假说（英語：hygiene hypothesis）或老朋友假說（英語：old friend hypothesis），是一种医学假说，指童年时因缺少接触传染源、共生微生物（如胃肠道菌群、益生菌）与寄生蟲，从而抑制了免疫系统的正常发展，进而增加了罹患过敏性疾病的可能性。发达国家青少年自體免疫性疾病与急性淋巴性白血病发病率的增加被认为与卫生假说有关。一些证据指出自闭症與某些免疫疾病細胞因子有關，有一篇文獻推測卫生假说可能是导致自闭症的原因之一。
近40年来生活在北美洲，欧洲等工业化国家的儿童确诊过敏和自體免疫性疾病的概率有惊人的提升。相对而言，生活在发展中国家的青少年儿童相关疾病的确诊概率处于一个稳定的状态。 例如美国在1980年至1995年哮喘的确诊人数提升了75%，患有枯草热的人数提升了10%. 目前可以明确的是导致过敏性疾病人数大量提升的原因有：儿童时代细菌性或病毒性感染发生次数较少，例如细菌性肠道感染，抗生素滥用，独生子女比生活在多子家庭的儿童更容易患上过敏性疾病，以及良好的卫生条件等。
针对于上述过敏性疾病在发达国家的确诊情况，有一些举措可能对该情况有缓解作用，例如在出生后第一到三个月内摄入一些含有过敏原的食物例如大豆，牛奶等，母乳喂养至少持续3-6个月，在出生后第一年内暴露在细菌环境下， 出生后二年内生活在有动物居住的环境内；暴露并接触含有脂多糖的抗原以促进CD14受体和Toll样受体的发育；在出生后六个月内摄入例如乳酸杆菌之类的益生菌可促进婴儿体内的Th2 ,辅助性T细胞2基础的免疫反应向Th1, 辅助性T细胞1型基础免疫反应的过渡。但是例如环境污染，真菌性过敏原，鼻病毒感染，等其他因素无法帮助儿童免疫系统的正常发展。