在分子生物学和生物信息学中,共有序列是最常见的核酸或者氨基酸残基的计算规则,序列比对中的每个序列中存在,代表多个相关序列被比较,计算相似的序列基元。当考虑序列依赖酶,例如RNA聚合酶时,这些訊息十分重要。